关键词

生信绘图, 在线分析

云工具介绍

云工具指的完成某一个具体的生信分析绘图的工具。

界面介绍

以下是云工具的具体操作界面介绍

用箱线图的界面举例，如图所示，主要分为2大部分：

  1. 结果呈现区域：生信分析绘图的结果会实时的呈现在这里
  2. 控制台：

    • 提交：修改完数据参数后，点击提交，开始分析绘图。

    • 数据：用户上传的数据

    • 基本参数：该云工具提供的可供修改的参数

    • 坐标轴：修改图片的坐标轴选项

    • 颜色：修改图片的颜色选项

操作示例

下面以箱线图的用法举例说明，云工具该如何使用。其他各工具的说明请参考教程的对应地方。

上传文件

  • 打开我们的箱线图模块。打开后就可以看到我们的demo图片，以及demo数据。

  • 查看demo数据，将自己的数据整理为相同的样式。支持txt，tsv，xlsx，xls，csv等多种格式。

  • 上传文件：首先选择上传的文件类型。接着点击”选择文件”按钮上传自己的文件。上传的文件，会在表格区实时展示。

    • 上传文件后，还可以点击”编辑”按钮，在线用excel编辑自己的数据。

修改参数

根据需求调整参数即可。箱线图可供调整的参数有，基本参数，坐标轴参数，颜色参数等。

  • 基本参数：每个云工具可供调整的基本参数不太一样，例如，箱线图可以修改的参数有是否对数据进行对数处理，是否在箱线图的基础上，再绘制抖动散点图。

基本参数
  • 坐标轴参数：可以调整图片各个坐标轴字体的大小，字体倾斜角度，内容名称，图例位置等参数。

坐标轴参数
  • 颜色参数：可以使用多种配色方案自定义自己的图形，当然也可以选择自定义颜色，完全自定义自己的图形。

颜色参数

提交

提交。上传完数据，并调好参数后，点击右上方”提交”按钮，稍等片刻，结果会出现在左侧。如果没有上传自己的数据，会使用默认的demo数据。

当然在预览结果后，可以再次修改参数，再次提交。

有的云工具，在提交按钮的右侧，还有有个”动态图 OR 静态图”的选项，用户可以在这里设置输出结果的格式，是html的可以交互的动态图，还是png，pdf等科研论文中常见的静态图。

下载

当您满意自己结果后，可以在控制台的”基本参数”设置里，调整图片的宽高分辨率，然后点击下载按钮，将结果保存到本地。

项目中心中查看

当云工具关闭后，之前的绘图记录会保存下来，您可以在项目中心中重新打开上次的项目，查看参数，下载结果。

也可以重新修改参数并提交，我们会创建新的任务，之前的不会被覆盖掉。