R语言与生物信息学

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心有灵犀(同名知乎)

R语言与生物信息学

前言

BioLadder是由北京青莲百奥生物科技有限公司和国家蛋白质科学中心·北京生物信息平台联合出品。为广大的科研工作者提供方便、快捷的数据处理、功能分析和可视化作图服务。

BioLadder目前上线了生物学分析最常用的50多个模块，主要包括以下四类：

数据可视化：箱线图，南丁格尔玫瑰图，韦恩图，UpSet图，饼图，词云图，核密度图，小提琴图，弦图，柱形图等

组学数据分析：序列的多重比对，表达数据的CV曲线图，ROC曲线，T-SNE，热图，相关性热图等，趋势分析的mFuzz，差异分析的火山图，富集分析的气泡图，修饰位点上下游模体分析的seqLogo，Motif热图等

功能分析：GO弦图，相互作用网络图，富集分析

数据预处理：归一化，补值，FDR校正，长宽表互换等

本书有3个篇章：

重点是生信绘图。适合有一定R语言基础的童鞋观看。

内容还在持续更新中。

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